男性生殖器上长了一个疙瘩，可能是由于以下原因所致：

1.皮脂腺异位症：一般是由于皮脂腺发育的生理性变型，和皮脂腺增生所致。主要分布在阴茎皮肤之上，位于阴茎根部，可表现为白色凸起样疙瘩。一般疙瘩体积较小，呈粟粒样分布，不伴有其他症状。这种情况无需特殊治疗，平时只需要注意生殖器卫生即可。

2.尖锐湿疣：如果患者有过高危、不洁的性行为，就会导致人乳头瘤病毒感染。当病毒侵袭男性生殖器时就会出现菜花样的疙瘩，其表面不光滑，伴有疼痛。一般这种情况患者需要采用激光、液氮冷冻的方式去除疙瘩。

3.毛囊炎：如果患者平时不注意个人私处卫生，就会导致男性生殖器上的毛囊受到细菌感染。随着病情的加重，就会在男性生殖器上长一个，或者多个疙瘩。这时患者可采用莫匹罗星乳膏、夫西地酸乳膏等抗生素药物进行治疗。